如何安装 ChatSpatial 空间转录组？

推荐在 Claude Code（本地）中安装：1. 确保已安装 Claude Code CLI 2. 复制下方命令，将替换为真实环境变量值后，在终端执行 3. 若下方列出了环境变量，请对照填写命令示例：claude mcp add chatspatial -- uvx chatspatial

ChatSpatial 空间转录组适用于哪些场景？

ChatSpatial 空间转录组适用于：代码审查与 GitHub、Cursor 开发必备。也可在 AgentHub 场景页查看配套 MCP 与 Skill。

ChatSpatial 空间转录组 MCP配置与使用教程

Q: ChatSpatial 空间转录组 是什么？

通过 MCP 提供模式强约束的空间转录组分析，含 20 个工具与 66 种方法。 ChatSpatial 空间转录组 是一个MCP Server，收录自 官方 MCP Registry。支持 stdio 传输。本页提供产品介绍、配置教程、安装命令与适用场景，支持 Trae、通义灵码、Cursor、Claude Code、VS Code 等。

Q: 如何安装 ChatSpatial 空间转录组？

推荐在 Claude Code（本地） 中安装：1. 确保已安装 Claude Code CLI 2. 复制下方命令，将 替换为真实环境变量值后，在终端执行 3. 若下方列出了环境变量，请对照填写 命令示例：claude mcp add chatspatial -- uvx chatspatial

Q: ChatSpatial 空间转录组 适用于哪些场景？

ChatSpatial 空间转录组 适用于：代码审查与 GitHub、Cursor 开发必备。也可在 AgentHub 场景页查看配套 MCP 与 Skill。

MCP ServerMCP Registry官方收录

io.github.cafferychen777/chatspatial · v1.5.9

通过 MCP 提供模式强约束的空间转录组分析，含 20 个工具与 66 种方法。

原文名称：ChatSpatial

原文描述：Schema-enforced spatial transcriptomics analysis with 20 tools and 66 methods via MCP

在 MCP Registry 查看 ↗源仓库 ↗

建议先在本页复制安装配置，再到上游核对文档与权限。

产品介绍

通过 MCP 提供模式强约束的空间转录组分析，含 20 个工具与 66 种方法。 ChatSpatial 空间转录组是一个MCP Server，收录自官方 MCP Registry。支持 stdio 传输。本页提供产品介绍、配置教程、安装命令与适用场景，支持 Trae、通义灵码、Cursor、Claude Code、VS Code 等。

适用场景

代码审查与 GitHub Cursor 开发必备

AgentHub Verified 可用性验证技术测试通过

自动化测试流水线已校验安装命令、传输协议与客户端兼容性

最近校验时间2026-10-11

安装配置格式测试有效CLI 与 mcpServers JSON 语法校验通过

协议连接与握手响应正常支持标准 JSON-RPC 2.0 规格规范

上游数据源存活来源 official-mcp-registry，可正常下载依赖

测试可用客户端Claude Code、Claude Desktop、Cursor 等

安全等级： A+ 级 · 官方认证推荐 (A+)·该工具由官方或知名生态团队维护，源码遵循标准开源许可协议，可安全接入 Cursor / Claude。

Score 90/100

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打开项目根目录下的 .cursor/mcp.json（没有就新建）
点击「复制配置」粘贴进去；若已有其他 MCP，只合并 mcpServers 里的本条目
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥（见下方「环境变量」）
保存后按 Cmd+Shift+P（Windows：Ctrl+Shift+P）→ 输入 Reload Window 并执行

点击「复制配置」直接粘贴到客户端

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

配置教程

打开 ChatSpatial 空间转录组详情页，确认这是你需要的 MCP Server（来源官方 MCP Registry）。
按客户端选择 Trae、通义灵码、Cursor、Claude Code 或 VS Code，复制 JSON 配置或 CLI 命令。
将配置合并进 mcpServers，并把环境变量占位符替换为真实密钥。
重载窗口后，在 Agent 对话中调用该 MCP 提供的工具。

安装命令

以下安装命令与配置步骤已写入页面 HTML，搜索引擎与未启用 JavaScript 的浏览器均可直接读取。

Claude Code（本地）

确保已安装 Claude Code CLI
复制下方命令，将 <占位符> 替换为真实环境变量值后，在终端执行
若下方列出了环境变量，请对照填写

claude mcp add chatspatial -- uvx chatspatial

Cursor — .cursor/mcp.json（本地）

打开项目根目录下的 .cursor/mcp.json（没有就新建）
点击「复制配置」粘贴进去；若已有其他 MCP，只合并 mcpServers 里的本条目
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥（见下方「环境变量」）
保存后按 Cmd+Shift+P（Windows：Ctrl+Shift+P）→ 输入 Reload Window 并执行

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

VS Code — .vscode/mcp.json（本地）

确保 VS Code 已安装 GitHub Copilot 扩展并支持 MCP
打开项目根目录下的 .vscode/mcp.json（没有就新建）
点击「复制配置」粘贴；若已有其他 MCP，只合并 mcpServers 里的本条目
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥（见下方「环境变量」）
保存后重新加载 VS Code 窗口

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

Claude Desktop — claude_desktop_config.json（本地）

打开 Claude Desktop 的 claude_desktop_config.json（路径见远程指引）
点击「复制配置」合并到 mcpServers
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥
完全退出并重启 Claude Desktop

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

Trae — .trae/mcp.json（本地）

打开 Trae → 设置 → MCP，或编辑 .trae/mcp.json / 全局 mcp.json
点击「复制配置」粘贴并合并 mcpServers
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥
保存后重载 Trae 窗口

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

Cherry Studio — MCP 设置（本地）

打开 Cherry Studio → 设置 → MCP 服务器 → 添加（STDIO）
也可直接导入下方 JSON：点击「复制配置」合并到 mcpServers
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥，并确保本机已安装 Node.js / uv（npx、uvx）
启用服务并查看工具列表是否加载成功

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

通义灵码 — MCP 配置（本地）

通义灵码：个人设置 → MCP 服务 → 「+」→ 手工添加（STDIO）或配置文件添加
点击「复制配置」合并 mcpServers；命令/参数/环境变量与 JSON 一致
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥；本机需 Node.js 18+（npx）或已安装 uv（uvx）
确认服务状态为已连接后再在智能体对话中调用

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

Windsurf — mcp_config.json（本地）

编辑 ~/.codeium/windsurf/mcp_config.json
点击「复制配置」合并 mcpServers（本地 stdio 与 Cursor 格式相同）
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥后保存并刷新 Cascade

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

Cline — MCP Servers（本地）

Cline 面板 → 设置 → MCP Servers
点击「复制配置」粘贴并合并
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥后保存

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

WorkBuddy — .workbuddy/mcp.json（本地）

编辑 ~/.workbuddy/mcp.json（用户级）或项目目录 .workbuddy/mcp.json
也可在界面：插件 → MCP 服务器 → 配置 MCP，粘贴下方 JSON
将 env 中的 <占位符> 替换为真实密钥；Windows 下 command/脚本路径建议用绝对路径
保存并重启 WorkBuddy，确认连接器状态为绿色

{
  "mcpServers": {
    "chatspatial": {
      "command": "uvx",
      "args": [
        "chatspatial"
      ]
    }
  }
}

常见报错排查与运行避坑 (Troubleshooting)FAQ

针对 ChatSpatial 空间转录组在 Cursor、Claude Code 中的常见连接错误与解决办法

在 Cursor / Claude Code 中配置 ChatSpatial 提示 connection closed 或 exit code 1？

通常由本地运行时环境缺失或命令路径未被 IDE 继承引起。排查步骤： 1. 确认已安装 Node.js 18+（支持 npx）或 Python 3.10+（支持 uvx）； 2. 尝试在终端运行 which npx 或 which uvx，把配置文件中的 "command" 字段改为完整绝对路径； 3. 修改 mcp.json 后，必须完全重载或重启客户端窗口。

Fix Snippet

# 终端测试命令是否存在：
which npx
node -v

提示 spawn npx ENOENT 或 command not found？

这是因为编辑器后台进程未加载完整的终端环境变量（PATH）。解决方案：在全局安装该包（如 npm install -g 包名），或在配置文件中将 command 设置为系统的实际路径（如 Windows 下的 C:\Program Files\nodejs\npx.cmd，Mac 下的 /usr/local/bin/npx）。

调用工具时响应超时或网络下载依赖失败？

国内环境下首次执行 npx 或拉取依赖时可能因网络受限而超时。建议将 npm 镜像源切换为国内高速镜像（npm config set registry https://registry.npmmirror.com），或在系统级开启开发代理工具。

仍连不上？查看 MCP 连接失败排查指南 →

免安装模拟调用 (Playground)

仿真环境

ChatSpatial 核心接口调用仿真 · 无需配置本地环境，直接预览调用参数与返回格式

沙盒就绪 (Virtual Mock)

fn: chatspatialSchema-enforced spatial transcriptomics analysis with 20 tools and 66 methods via MCP

请求入参 (Arguments)JSON Schema

{
  "target": "ChatSpatial",
  "action": "execute",
  "options": {
    "mode": "standard",
    "timeoutMs": 5000
  }
}

💡Agent 在规划任务时会自动生成并传递上述入参

Agent Tool Output

点击上方「模拟运行」按钮

查看该工具在 Agent 内部的返回数据格式

测试环境：AgentHub Virtual SandboxJSON-RPC 2.0

选型与决策建议（为什么选它？）

帮助你快速判断该资源是否契合当前项目，避免盲目折腾

适合什么任务？

PR 自动审查
生成 changelog
跨仓库 Issue 检索

什么时候不建议用？

替代人工安全审计
在无授权仓库上操作

推荐工作流搭配：查看完整场景 →

ChatSpatial + 对应场景 Prompt → 组成标准 Agent 自动化任务

MCP 实战教程：从安装到看见效果

按完整实例走一遍（含期望效果与对比验收）。装完本页资源后，用教程里的提示词核对是否真正生效。

打开教程 →

常搭配使用

中文公文写作

v2.0.35

SkillClawHub9.7k

io.clawhub.gongyu0918-debug/chinese-official-writing

用于中文公文、事务性材料和新闻稿件的起草、改写、压缩、润色、审校、文种核对、去口语化、降 AI 味及 Word 格式处理，适用于机关、企事业单位、学校和新闻机构。涵盖申请、请示、报告、通知、通告、意见、决定、决议、议案、公报、命令、函、复函、批复、说明、方案、纪要、公告、公示、通报、制度、规定、办法、细则、操作规程、工作要点、总结、调研、讲话、致辞、主持词、述职、可研、审查材料、技术需求、新闻消息、编者按、新闻评论，以及采购、整改、反馈和 AI 算力等场景。

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Canonry

v7.45.1+c90d226

SkillClawHub9.2k

io.clawhub.arberx/canonry

通过已连接的 MCP 工具或 cnry CLI 导航 Canonry，检查证据、诊断变更、规划度量、审查集成并报告结果。这是一个可选的宿主原生技能，适用于 CLI 工作流与详细引用；已接入 MCP 的用户可通过 canonry_help 操作，无需安装本地运行时或技能。

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AI 保险顾问（中国大陆）

v2.0.163

SkillClawHub8.7k

io.clawhub.mnetfairy/ai-insurance-advisor

中国大陆保险顾问。本 skill 仅覆盖 6 项实际实现的能力：保险需求分析（needs_analyzer.py）、产品对比（premium_calculator.py + 本地 products.json）、保费计算（premium_calculator.py）、方案设计（plan_designer.py）、保险知识问答（insurance-knowledge.md）、合规要点提示（compliance.md）。不提供核保预审、理赔代办、朋友圈/营销文案生成、培训话术、代理人展业工具等能力——这些场景请转人工或调用专业服务。

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中国大陆 AI 保险顾问

v2.0.178

SkillClawHub8.6k

io.clawhub.mnetfairy/insurance-advisor-china

中国大陆AI保险顾问。为个人和家庭提供全方位的保险咨询、产品对比、方案设计、投保指导。当用户询问保险配置、保险方案、产品对比、重疾险/医疗险/寿险/意外险/储蓄险推荐、保费计算、保障缺口分析、需求分析、核保合规、理赔等问题时使用。

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统一 Manifest

{
  "id": "io.github.cafferychen777/chatspatial",
  "type": "mcp-server",
  "version": "1.5.9",
  "displayName": "ChatSpatial",
  "description": "Schema-enforced spatial transcriptomics analysis with 20 tools and 66 methods via MCP",
  "repository": {
    "url": "https://github.com/cafferychen777/ChatSpatial",
    "source": "github"
  },
  "homepage": "https://docs.cafferyang.com/",
  "distribution": {
    "packages": [
      {
        "registryType": "pypi",
        "identifier": "chatspatial",
        "version": "1.5.9",
        "runtimeHint": "uvx",
        "transport": "stdio"
      }
    ],
    "remotes": []
  },
  "dependencies": [],
  "installTargets": [
    "claude-code",
    "claude-desktop",
    "cursor",
    "vscode",
    "trae",
    "cherry-studio",
    "lingma",
    "windsurf",
    "cline",
    "workbuddy"
  ],
  "keywords": [],
  "provenance": {
    "origin": "official-mcp-registry",
    "originalId": "io.github.cafferychen777/chatspatial",
    "originalUrl": "https://registry.modelcontextprotocol.io/v0.1/servers/io.github.cafferychen777%2Fchatspatial/versions/latest",
    "isOfficial": true,
    "status": "active"
  }
}

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