搜索「Python Code」的结果

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/pysam

基于 Python/HTSlib 的基因组文件工作流。在使用 pysam 读取、查询、过滤或写出 SAM/BAM/CRAM、VCF/BCF、FASTA/FASTQ 或 tabix 数据时使用，包括 pileup、覆盖度、索引与 CRAM 参考。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/paperclip

使用 GXL 的 Paperclip CLI 检索和阅读生物医学论文全文、FDA/PMDA/EMA 监管文件、临床试验注册信息和 UniProt/PDB/ChEMBL 条目。涵盖用 PAPERCLIP_API_KEY 安装与鉴权 `paperclip` 二进制、/papers、/fda、/trials、/proteins、/clipboard 下的只读虚拟文件系统、来源范围的语义搜索、全语料 grep、元数据查询与 SQL、跨多篇论文的 map/reduce 阅读、图像视觉分析、带论断核验的可选论文仓库，以及锁定行号的引用。当被要求安装 paperclip、运行 paperclip search/grep/map/reduce/sql/repo、通过 paperclip 查找或阅读生物医学文献、监管文件或临床试验，或生成带行号的引用时使用。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/bioservices

40+ 生物信息学服务的统一 Python 接口。适用于在单个工作流中查询多个数据库（UniProt、KEGG、ChEMBL、Reactome）并使用一致的 API。最适合跨库分析与跨服务 ID 映射。快速单库查询用 gget；序列/文件操作用 biopython。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/gget

对 20+ 生物信息学数据库的快速 CLI/Python 查询。适合快速查询：基因信息、BLAST/BLAT、病毒序列下载、AlphaFold 结构、富集分析、OpenTargets、COSMIC、CELLxGENE 以及 8cube 小鼠特异性/表达数据。最适合交互式探索和简单查询。批量处理或高级 BLAST 用 biopython；跨库 Python 工作流用 bioservices。

skillsmp.ruvnet-ruflo-skill-md

Ruflo 是面向 AI 编码 agent（Claude Code、Cursor、Codex、Copilot、Gemini、Amp 及另外 12 家）的多 agent 编排平台。当用户希望：(1)在项目中安装/初始化 ruflo；(2)运行采用分层协同的多 agent swarm；(3)使用 ruflo 的 314+ MCP 工具处理记忆、路由、钩子、sub-agent 或工作流；(4)查看 ruflo 状态/版本/doctor 健康检查；(5)为任务挑选合适的 ruflo 插件（共 30+）时使用本 skill。

io.github.BerriAI/litellm/rust-tracing

Add or change Rust diagnostic tracing in litellm-rust, including route spans, subscriber layers, and Python logger delivery

io.github.affaan-m/ECC/ecc-guide

Answer questions about Everything Claude Code by reading the live repo surface — agents, skills, commands, hooks, rules, install profiles, and docs — instead of memory. Use when the user asks what ECC includes, how to install or reset it, which skill or command fits a task, or how project onboarding works.

io.github.affaan-m/ECC/videodb

Ingest, index, search, edit, and monitor video and audio with the VideoDB Python SDK — upload from files, URLs, or RTSP feeds, build spoken and scene indexes with timestamped search and playable clips, transcode and reframe, do timeline edits (subtitles, overlays, dubbing), and run real-time alerts on live streams or desktop capture. Use when working with video search, transcription, clipping, transcoding, streaming, or live video alerts.

io.github.affaan-m/ECC/verification-loop

面向 Claude Code 会话的全面验证系统。在宣称任务完成前验证 Claude Code 会话的工作成果时使用。

io.github.affaan-m/ECC/ck

为 Claude Code 提供按项目持久化的记忆。会话启动时自动加载项目上下文，用 git 活动追踪会话，并写入原生记忆。命令运行确定性的 Node.js 脚本——行为在各模型版本之间保持一致。当项目需要让上下文在多次 Claude Code 会话之间保留、而不必每次重新解释时使用。

io.github.different-ai/openwork/connect-openwork-mcp

Connect the OpenWork MCP Gateway (https://api.openworklabs.com/mcp/agent) to Claude Code, Codex, Gemini CLI, Cursor, VS Code, Claude Desktop, or ChatGPT so the agent can use the user's OpenWork organization skills, plugins, and connections.

io.github.rohitg00/ai-engineering-from-scratch/mcpa-certification

AI-native tutor and onboarding workflow for the MCPA (Model Context Protocol Associate) certification in AI Engineering from Scratch. Use when a learner wants to prepare for the MCPA, resume their certification path, learn the next lesson interactively, run and verify practical labs, take the diagnostic or a full mock, or remediate weak exam domains from GitHub with Claude Code, Codex, ChatGPT, Cursor, or another agent.

io.github.odoo/odoo/odoo-guidelines

House rules for Odoo addon code: module structure, manifest, Python/ORM, fields, controllers, XML views and data, QWeb reports, access rights and record rules, performance, tests. Use when writing or reviewing any file in an Odoo addon outside static/ (for the JavaScript, Owl templates and SCSS under static/, see odoo-web-guidelines).

io.github.CherryHQ/cherry-studio/cherry-tool-guide

面向通用 agent 的 Cherry Studio 一方工具与内置 shell 路由。在支持 shell 的会话中处理直接的本地工作时:用 `bun <file>` 运行 JS/TS、用 `bun x` 运行一次性 JS 工具;用 `uv run [--with <pkg>] python` 运行 Python、用 `uvx` 运行一次性 Python CLI;搜索用 `rg`。在修改项目依赖、判断工具用临时还是复用方式、读取或转换本地 Office/PDF 文件、跨 Agent 会话协调或委派,或使用 Cherry 自有的 web/浏览器、知识库、持久记忆、日程/通知、IM 渠道、图像生成、产物报告、托管 CLI、技能或 MCP 服务器注册能力前先加载本指南——即使用户没有点名工具。在处理 shell/文件变通方案前先查阅;以实时工具 schema 为准。

io.github.google/skills/google-ads-api-mcp-setup

引导开发者下载、配置并安装官方开源的 Google Ads MCP 服务器。当用户想把其 AI 助手（如 Gemini、Claude Code 或 Cursor）连接到 Google Ads 账户，以自然语言查询广告系列或获取报告指标时使用。

io.github.sickn33/agentic-awesome-skills/ai-coding-agent-guardrails

Secure AI coding agents (Claude Code, Cursor, Codex, Copilot) with permission boundaries, secret protection, code review gates, and safe sandbox configurations for team environments.

io.github.sickn33/agentic-awesome-skills/hubspot-integration

Expert patterns for HubSpot CRM integration including OAuth authentication, CRM objects, associations, batch operations, webhooks, and custom objects. Covers Node.js and Python SDKs.

io.github.sickn33/agentic-awesome-skills/hugging-face-trackio

Track and visualize ML training experiments with Trackio. Use when logging metrics during training (Python API), firing alerts for training diagnostics, or retrieving/analyzing logged metrics (CLI).

io.github.slopus/happy/release

面向 CLI、移动端、Web 与后端的发布流水线。引导版本递增、构建、测试、发布与部署。以 Claude Code 原生体验取代旧的交互式 release-it 流程。当用户输入 /release，或要求发布、推送、部署或交付任意组件时使用。

io.github.debpalash/VoiceStudio/voicestudio-maintainer

Triage GitHub issues, review contributor pull requests, diagnose CI, and prepare explicitly requested releases for VoiceStudio's Electron desktop app and Python backend. Use for repository maintenance work, not ordinary VoiceStudio audio generation.

io.github.NousResearch/hermes-agent/jupyter-notebook

通过实时的 Jupyter 内核（hamelnb）迭代运行 Python。

io.github.affaan-m/ECC/verification-loop

面向 Claude Code 会话的全面验证系统。在宣称任务完成前验证 Claude Code 会话的工作成果时使用。

io.github.affaan-m/ECC/eval-harness

面向 Claude Code 会话的正式评估框架，落实评估驱动开发（EDD）原则。当 Claude Code 工作流在获得信任或被修改前需要正式评估时使用。

io.github.affaan-m/ECC/dmux-workflows

基于 dmux（面向 AI 代理的 tmux 面板管理器）的多代理编排。涵盖 Claude Code、Codex、OpenCode 等多种运行框架下的并行代理工作流模式。在并行运行多个代理会话或协调多代理开发工作流时使用。