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io.github.ruvnet/RuView/agentdb-memory-patterns

用 AgentDB 为 AI 代理实现持久化记忆模式，含会话记忆、长期存储、模式学习与上下文管理。在构建有状态代理、聊天系统或智能助手时使用。

io.github.ruvnet/RuView/agentdb-learning

用 AgentDB 的 9 种强化学习算法创建并训练 AI 学习插件，含 Decision Transformer、Q-Learning、SARSA、Actor-Critic 等。在构建自学习代理、实现 RL 或通过经验优化代理行为时使用。

io.github.ruvnet/RuView/agentdb-advanced

掌握 AgentDB 高级特性：QUIC 同步、多库管理、自定义距离度量、混合检索与分布式系统集成。在构建分布式 AI 系统、多代理协调或高级向量检索应用时使用。

io.github.YPares/agent-skills/cursor-agent-supervisor

把范围明确的委派给子智能体，例如让某个子智能体按一组规格实现功能。当任务不需要了解整个项目的宽泛背景时应使用本技能。

io.github.MaxMiksa/Auto-Company/agent-browser

面向 AI agent 的浏览器自动化 CLI。当用户需要与网站交互时使用，包括浏览页面、填写表单、点击按钮、截图、提取数据、测试 Web 应用或自动化任何浏览器任务。触发请求如“open a website”“fill out a form”“click a button”“take a screenshot”“scrape data from a page”“test this web app”“login to a site”“automate browser actions”，或任何需要程序化 Web 交互的任务。

io.github.anthropics/claude-code/agent-development

当用户要求“create an agent”“add an agent”“write a subagent”“agent frontmatter”“when to use description”“agent examples”“agent tools”“agent colors”“autonomous agent”，或需要关于 agent 结构、系统提示、触发条件，或 Claude Code 插件 agent 开发最佳实践的指导时使用。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/polars-bio

Performs genomic interval overlap, nearest, merge, coverage, complement and subtraction on Polars DataFrames, and reads or writes BED, VCF, BCF, BAM, CRAM, GFF, GTF, FASTA and FASTQ data. Use for coordinate-aware genomic joins, read-depth analysis, lazy bioinformatics I/O, SQL queries or migration from bioframe.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/imaging-data-commons

Queries and downloads public cancer imaging data from NCI Imaging Data Commons. Supports IDC collection discovery, DICOM access, radiology (CT, MR, PET) and pathology AI datasets, metadata SQL, visualization, licensing, and citations. Uses public metadata and download routes without authentication; optional BigQuery and Google Healthcare routes require Google credentials.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/cantera

Runs Cantera homogeneous chemical reactors and evaluates ignition delay with mechanism provenance, conservation checks, and numerical refinement. Use for combustion kinetics, closed adiabatic ideal-gas constant-volume or constant-pressure ignition, temperature histories, or mechanism-specific ignition-delay comparisons.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/pycalphad

Computes finite-temperature CALPHAD equilibria, phase fractions, and phase compositions from thermodynamic TDB databases using pycalphad. Use for alloy phase stability, equilibrium temperature sweeps, tie lines, lever-rule checks, or reproducible phase-fraction calculations with explicit components and mole-fraction conditions.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/pydeseq2

Performs bulk RNA-seq differential expression analysis with PyDESeq2, including count validation, formula designs, explicit contrasts, Wald tests, FDR correction, coefficient-matched LFC shrinkage, and result visualization. Use for PyDESeq2 or Python DESeq2 workflows with biological replicates.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/dask

Scales pandas, NumPy, and custom Python research workflows beyond memory or across clusters with Dask. Covers DataFrames, Arrays, Bags, Futures, chunking, schedulers, and distributed diagnostics. Use for partitioned file processing, scientific array computation, or parallel tasks whose memory and dependency structure require Dask.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/matlab

Builds, reviews, migrates, and plans MATLAB or GNU Octave numerical workflows. Use for arrays, tabular/time data, tests, projects, graphics, MAT files, and explicit Python interoperability.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/geomaster

Supports geospatial research workflows for remote sensing, vector and raster GIS, spatial statistics, terrain and network analysis, and machine learning for Earth observation. Use when processing satellite imagery, aligning coordinate systems and raster grids, accessing STAC catalogs, analyzing geospatial time series, or implementing scientific GIS workflows in Python, R, Julia, JavaScript, C++, Java, Go, or Rust.

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/opentrons-integration

为 Flex 与 OT-2 机器人编写、审查、迁移、仿真并排查官方 Opentrons Python Protocol API v2 协议。适用于机器人专属的液体处理、deck 与 labware 设置、移液器、模块、运行时参数、液体类别，以及 Opentrons App 分析。当同一工作流需要支持多品牌机器人时改用 pylabrobot。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/gtars

在 Python、Rust 与 CLI 中使用 Gtars 完成本地基因组区间模型与集合代数、重叠与计数、consensus 与覆盖度、tokenization、片段处理，以及 refget/BEDbase 规划。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/networkx

使用 NetworkX 在 Python 中创建、分析和可视化复杂网络与图。适用于处理网络/图数据结构、运行图算法（最短路径、中心性、聚类）、社区发现、生成合成网络（随机图、无标度图、小世界图）、读写图文件格式，或绘制网络拓扑。常见应用包括社交、生物、交通与引文网络。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/latchbio-integration

使用 Python SDK、CLI、Latch Data 与 Registry、Nextflow、Snakemake、程序化执行与 Latch MCP，在 Latch 平台上构建、注册、调试并运行生物信息学工作流。适用于编写或部署 Latch 工作流、配置资源或接口、搬运数据、集成 Registry，以及启动和监控运行。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/rowan

Rowan 是带 Python API 的云原生分子建模与药物化学工作流平台。适用于 pKa 与大分子 pKa 预测、构象与互变异构体系综、对接与类似物对接、蛋白-配体共折叠、MSA 生成、分子动力学、通透性、描述符工作流，以及相关的小分子或蛋白建模任务。适合程序化批量筛选、多步化学流水线，以及原本需要自建 HPC/GPU 基础设施的工作流。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/pyzotero

使用 pyzotero Python 客户端操作 Zotero 参考文献库。通过 Zotero Web API v3 检索、创建、更新和删除条目、合集、标签与附件。适用于以编程方式操作 Zotero 文库、管理文献引用、导出引文、检索文库内容、上传 PDF 附件，或构建与 Zotero 集成的科研自动化工作流。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/modal

Modal 是按需运行 Python（含按需 GPU）的无服务器云平台。在使用 Modal SDK 部署或托管 AI/ML 模型、运行 GPU 加速负载（训练、微调、推理）、托管 Web 端点、调度批处理任务，或将 Python 代码扩展到云容器时使用。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/adaptyv

如何使用 Adaptyv Bio Foundry API 与 Python SDK 进行蛋白实验设计、提交与结果获取。只要用户提到 Adaptyv、Foundry API、蛋白结合实验、蛋白筛选实验、BLI/SPR 实验、热稳定性实验，或想提交蛋白序列进行实验表征，就使用本技能。当代码导入 `adaptyv`、`adaptyv_sdk`、`FoundryClient`，或引用 `foundry-api-public.adaptyvbio.com` 时也应触发。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/polars

面向 Python ETL、分析与 pandas 迁移的高性能 DataFrame 库。适用于基于表达式的数据操作，支持惰性查询优化、并行执行、流式跨核处理、Arrow 互操作与可选的 GPU 执行。

io.github.K-Dense-AI/scientific-agent-skills/geopandas

面向直接使用 GeoPandas GeoSeries、GeoDataFrame、空间运算或矢量数据 I/O 的 Python 工作流的指导与本地审计工具。